Viešoji įstaiga Pal. J. Matulaičio šeimos pagalbos centras įsteigta 2003 metų lapkričio 10 d. Organizacija buvo įsteigta teikti specializuotas, arčiau kliento namų esančias socialines paslaugas visai šeimai. Organizacijos steigėjai yra keturi fiziniai asmenys ir viešoji įstaiga Pal. J. Matulaičio socialinis centras, savo veiklą orientuojantis į bendruomeninių socialinių paslaugų tinklo kūrimą.

Pal. J. Matulaičio socialinis centras savo veiklą vykdo nuo 2000 metų, nors dauguma paslaugų buvo pradėta teikti jau nuo 1996 metų Pal. J. Matulaičio parapijoje. Siekiant teikti specializuotą profesionalią pagalbą šeimai bei norint priartinti teikiamas paslaugas prie klientų ir buvo įkurta atskira organizacija Pal. J. Matulaičio šeimos pagalbos centras. Tad dabar Pal. J. Matulaičio parapijos teritorijoje, kuri apima Viršuliškių, Pašilaičių, Šeškinės ir Justiniškių mikrorajonus, veikia du socialines paslaugas teikiantys centrai.